根据《中央编办关于国家卫生健康委所属事业单位机构编制调整的批复》(中央编办复字〔2018〕90号)，设立国家卫生健康委南京人口国际培训中心，为国家卫生健康委直属事业单位。主要职责为：
(一)参与卫生健康系统干部队伍建设研究，提供相关技术支持和服务。
(二)参与拟订卫生健康系统继续教育的政策、法规及发展规划并组织落实，开展干部教育理论研究。
(三)承担全国卫生健康系统工作人员业务培训，参与实施公立医院领导人员职业化培训。
(四)承办人口和健康多边、双边国际培训与交流任务;参与开发、实施人口和健康国际合作项目。
(五)负责国家健康医疗开放大学南京开放大学的建设与运行。
(六)承办国家卫生健康委交办的其他事项。