巴西蕉多酚氧化酶的基因克隆及序列分析

基于香蕉基因组的信息,利用电子克隆方法获得巴西蕉PPO基因,结合RT-PCR验证,并通过生物信息学软件对巴西蕉PPO进行序列分析。结果表明,成功获得编码巴西蕉PPO的新基因,序列长度为1 767bp,编码588个氨基酸（Gen Bank登录号：KF900300.1）。巴西蕉PPO基因与禾本科植物PPO基因有着较高的同源性,相似度在82%~85%,与蔷薇科鸡麻亲缘关系最近。巴西蕉PPO最有可能存在于叶绿体中,不具有信号肽,含有一个长度为47个氨基酸的叶绿体转运肽。巴西蕉PPO蛋白属于酪氨酸酶基因家族蛋白,具有酪氨酸酶超级家族、PPO1_DWL和PPO1_KFDV3个保守结构域。巴西蕉PPO分子量为65.6 KDa,等电点为6.32,为亲水性蛋白质。巴西蕉PPO二级结构中无规则卷曲占的比例最高为57.31%,成功预测得到巴西蕉PPO的三级结构模型。

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本文档关键词:序列,克隆,基因,氧化酶,巴西