食管鳞状细胞癌顺铂耐药关键基因及临床病理分析

目的探索在食管鳞癌(ESCC)进展中驱动顺铂耐药的关键基因,并分析其与肿瘤临床病理因素的关系。方法从高通量基因表达数据库通过GPL21290和GPL570平台下载并分析GSE169337和GSE161533,以获得差异表达基因,并对两个数据集取交集。使用STRING数据库和Cytoscape软件建立蛋白质-蛋白质相互作用网络并确定关键基因。DAVID数据库对GSE169337的差异基因进行生物学功能和途径富集分析。利用癌症基因组图谱数据和TIMER分析和验证关键基因在食管癌中的表达情况、免疫细胞浸润、临床病理因素(肿瘤分期、性别、吸烟状态、淋巴结转移及TP53状态)的关系及预后价值。结果生物学功能和途径富集分析示,差异基因与免疫反应存在潜在联系。确定并验证了在ESCC进展过程中顺铂耐药的10个关键基因,其中GBP1、IFI44L与食管癌组织中多种免疫细胞浸润程度呈正相关(r>0,P<0.05);在不同食管癌分期中IFI44L表达水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);与无淋巴结转移食管癌患者比较,早期淋巴结转移的食管癌患者GBP1高表达(P<0.05);IFI6、RTP4高表达患者生存率低于低表达患者(P<0.05)。结论本研究有助于ESCC顺铂耐药性的分子机制研究,联合免疫治疗是抑制顺铂耐药的重要方向。

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本文档关键词:食管,病理,临床,细胞,基因