计算机化学实践基础教程
出版时间:2013年版
内容简介
计算机化学是以计算机为技术手段,建立化学化工信息资源化和智能化处理的一套理论和方法。《计算机化学实践基础教程》针对学生在计算机化学学习及研究过程中可能会遇到的各种问题,以直观的图文注解方式进行讲解,并穿插操作技巧和方法。《计算机化学实践基础教程》包括化学信息库、化学分子结构绘制、Linux基础知识、计算机化学模拟、数据处理及作图、Perl程序编写等内容。每一章均自成体系,可单独阅读。《计算机化学实践基础教程》最后给出一个计算机化学科学研究实例,总结了各个章节在该实例中的应用。《计算机化学实践基础教程》可作为高等院校的化学信息学、生物物理学及其他相关专业教材,也可作为相关领域研究人员的入门教材,对信息处理人员也有一定的参考作用。
目录
前言
第一章 化学信息学网络资源
第一节 化学信息学数据库
第二节 电子图书阅读工具——Adobe Acrobat
第三节 蛋白质结构数据库
第四节 文献数据库——Web of Science
参考文献
第二章 分子结构绘制及显示
第一节 小分子结构绘制及创建——ChemDraw
第二节 小分子结构显示——Chem3D
第三节 生物大分子结构显示——VMD
第四节 生物大分子结构显示——Spdbv
参考文献
第三章 Linux基础
第一节 Linux简介
第二节 文件操作命令
第三节 目录操作及联机帮助命令
第四节 进程及其管理
第五节 文本编辑
参考文献
第四章 分子模拟
第一节 分子对接——AutoDock
第二节 分子动力学模拟——AMBER
第三节 量子化学计算——Gaussian
参考文献
第五章 数据传输
第一节 常规下载——FlashGet
第二节 数据上传——CuteFTP
第三节 远程连接——Xmanager
参考文献
第六章 数据分析与绘图
第一节 数据分析——Excel
第二节 数据绘图——Origin
第三节 统计软件——SPSS
参考文献
第七章 图像处理
第一节 简单绘图——画图附件
第二节 图像编辑——Photoshop
第三节 图像绘制——CorelDraw
参考文献
第八章 计算机应用基础
第一节 文本编辑——Word
第二节 文本列操作——UltraEdit
第三节 流程图绘制——Visio
第四节 演示文稿制作——PowerPoint
参考文献
第九章 Perl语言初步
第一节 Perl安装及启动
第二节 Perl的基本语法
第三节 Perl的使用实例
参考文献
第十章 HIV-1整合酶与L708,906抑制剂结合模式及运动性的研究
第一节 计算方法
第二节 结果与讨论
第三节 与《计算机化学实践基础教程》的关联
参考文献
附录